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中山市2014-2016年6株Ⅱ型登革病毒E基因分子特征分析 |
谢颖, 高赛珍, 陈子龙, 王翠玲, 吴衍恒, 林金思 |
广东省中山市疾病预防控制中心,广东 中山 528403 |
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摘要 目的 分离鉴定中山市2014-2016年Ⅱ型登革病毒,从分子水平进行分析其地域来源和系统进化情况。方法 选取中山市2014-2016年核酸阳性血清6份,用C6/36细胞培养分离登革病毒,RT-PCR扩增毒株E基因并进行序列测定,分析其与不同区域流行株和国际标准株的同源性和系统进化情况。结果 成功分离培养出2株2014年登革Ⅱ病毒、2株2015年登革Ⅱ病毒、2株2016年登革Ⅱ病毒。ZS2014-02、ZS2014-03与2014年广州分离株D14115在进化关系上最近,2014年的3株病毒氨基酸和核苷酸同源性均达到91.3%以上;2015年ZS2015-01与广州分离株D14115在进化关系上最近,2015年2株病毒氨基酸和核苷酸同源性分别为98.8%和92.8%;2016年ZS2016-01与2010年巴布新几内亚分离株JN568270.1进化关系较近,2016年2株病毒氨基酸和核苷酸同源性分别为91.4%和88.8%。结论 6株毒株与国际标准株New Guinea C 登革Ⅱ型比较均存在氨基酸位点的差异。2014年2株毒株为广州输入病例,2015年的2株毒株ZS2015-01为广州输入,ZS2015-02为中山市本地二代病例,2016年的ZS2016-01为巴布新几内亚输入,而ZS2016-02为菲律宾输入病例。
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关键词 :
登革病毒,
E基因,
序列同源性,
系统进化
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收稿日期: 2018-05-14
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基金资助:中山市科技局医学科研立项课题(20132A73) |
作者简介: 谢颖(1983-),男,广东梅州人,本科学历,主管技师,主要从事卫生微生物检验工作。 |
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