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| 2013-2015年北京市丰台区腹泻患者肠产毒性大肠埃希菌的MLST分型 |
| 余红1, 董晓根1, 尉秀霞1, 秦萌1, 王兆娥1, 陈倩2 |
1.北京市丰台区疾病预防控制中心,北京 100071;
2.北京市疾病预防控制中心 |
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摘要 目的 了解2013-2015年北京市丰台区腹泻患者肠产毒性大肠埃希菌(ETEC)分布与分子分型特征,为ETEC的分子流行病学研究提供参考依据。方法 对2013-2015年北京市丰台区腹泻病例的粪便标本进行致病菌分离培养,采用MLST法,用eBURST V 3软件和MEGA 5.0对分离株进行分子分型及进化树分析。结果 从1 599例腹泻病患者粪便标本中检出ETEC 58株,分离率为3.6%(58/1 599)。58株ETEC分离株MLST分型结果为共分成19个型别,部分试验菌株形成2个ST克隆群,分别为STC-6007、STC-3103,分别同属于一个进化分支,多数菌株的遗传关系较远,可能与菌株来源多样有关。结论 ETEC感染2013-2015年在丰台区腹泻疾患中占较高比例,ST-6010与ST-69是最主要的ST型别。
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| 关键词 ：
致泻大肠埃希菌,
MLST分型,
管家基因,
进化树
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收稿日期: 2017-05-12
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| 基金资助:北京市疾病预防控制中心食物中毒诊断溯源北京市重点实验室开放基金(2015BZ0063-01);北京市丰台区卫生计生系统科研项目(2015-92) |
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通讯作者:
陈倩, E-mail:cchenqian@263.net。
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| 作者简介: 余红(1981-),女,河北任丘人,硕士,副高级检验师,研究方向:微生物检验。 |
[1] 高翔, 赵红庆, 甄博珺,等. 北京地区腹泻就诊患者中肠致病性大肠埃希菌分离株特征分析[J]. 疾病监测, 2013, 28(5):347-350.
[2] Qu M, Deng Y, Zhang X, et al. Etiology of acute diarrhea due to enteropathogenic bacteria in Beijing, China[J]. J Infect, 2012, 65(3):214-222.
[3] 茅俭英, 向伦辉, 沈隽卿,等. 2014年上海市宝山区腹泻病监测结果分析[J]. 实用预防医学, 2016, 23(2):215-218.
[4] 宫春波,王朝霞,董峰光. 2010-2014年烟台市即食生食动物性水产品中食源性致病菌污染状况调查[J]. 实用预防医学,2016,23(12):1440-1444.
[5] 汤泓, 李勇, 张平平,等. 上海市2012-2013年4种致泻性大肠埃希菌监测[J]. 中国医师杂志, 2015, 36(s2):1263-1268.
[6] Maiden MC, Bygraves JA, Feil E, et al. Multilocus sequence typing: a portable approach to the identification of clones within populations of pathogenic microorganisms[J]. Proc Nat Acad Sci USA, 1998, 95(6):3140-3145.
[7] Jefferies J, Clarke SC, Diggle MA, et al. Automated pneumococcal MLST using liquid-handling robotics and a capillary DNA sequencer[J]. Mol Biotech, 2003, 24(3):303-308.
[8] 姬小薇, 廖亚玲, 毛旭虎,等. MLST分析在病原微生物基因分型应用中的研究进展[J]. 国际检验医学杂志, 2011, 32(2):246-249.
[9] 李红, 白向宁, 赵爱兰,等. 2006-2014年中国八省份肠致病性大肠杆菌分离株的多位点序列分型分析[J]. 中华预防医学杂志, 2015,63(4):369-373.
[10] 白向宁, 赵爱兰, 夏胜利,等. 非O157产志贺毒素大肠杆菌分离株的多位点序列分型研究[J]. 中国人兽共患病学报, 2012, 28(6):544-548.
[11] 王春晓, 王晓宇, 刘桂荣,等. 72株大肠埃希菌参考菌株的基因组分型及种系发育关系[J]. 哈尔滨医科大学学报, 2013, 47(6):481-485. |
| [1] |
周健明, 邓义州, 洪泽涛, 洪敏丽, 金玉娟, 刘渠, 李静媚. 深圳市龙岗区2017年手足口病病原柯萨奇病毒A16型及肠道病毒71型VP1区基因特征分析[J]. 实用预防医学, 2019, 26(3): 371-374. |
| [2] |
宋川, 陈丹瑛, 杜鹏程, 韩俊燕, 张媛媛. 北京市29例新确证HIV-1感染者多区段序列病毒亚型分析[J]. 实用预防医学, 2016, 23(11): 1315-1318. |
| [3] |
王启广, 谌芳, 曹友德. 8种新型HPV的分型及特异型引物设计[J]. 实用预防医学, 2016, 23(1): 111-114. |
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2018, Vol. 25 
